Клиническая биохимия
O-(3-hydroxyvaleryl)-L-carnitine
O-(3-hydroxyvaleryl)-L-carnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxy-fatty acyl-L-carnitine». Для неё указаны формула C12H23NO5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C12H23NO5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 12, H — 23, N — 1, O — 5. Средняя масса составляет 261.318 Да, а моноизотопная масса — 261.15762 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-(3-hydroxyvaleryl)-L-carnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C12H23NO5 это приблизительно 2,61318 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C12H23NO5 — 3-hydroxyisovalerylcarnitine. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- O-(3-hydroxyvaleryl)-L-carnitine
- Класс ChEBI
- hydroxy-fatty acyl-L-carnitine
- Формула
- C12H23NO5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 261.318
- Моноизотопная масса, Да
- 261.15762
- InChIKey
- SHDVOJJCEZGPBX-QVDQXJPCSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-hydroxypentanoylcarnitine, 3-hydroxyvalerylcarnitine, Hydroxyvalerylcarnitine, O-(3-hydroxypentanoyl)-L-carnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:90407 · EMBL-EBI · CC BY 4.0