Биотрансформация веществ
11(R)-HEPE(1-)
11(R)-HEPE(1-) — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxy polyunsaturated fatty acid anion». Для неё указаны формула C20H29O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H29O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 29, O — 3. Средняя масса составляет 317.449 Да, а моноизотопная масса — 317.21222 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 11(R)-HEPE(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H29O3 это приблизительно 3,17449 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 11(R)-HEPE(1-) — сопряжённое основание для «11(R)-HEPE». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 11(R)-HEPE(1-)
- Класс ChEBI
- hydroxy polyunsaturated fatty acid anion
- Формула
- C20H29O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 317.449
- Моноизотопная масса, Да
- 317.21222
- InChIKey
- IDEHSDHMEMMYIR-DJWFCICMSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z,17Z)-eicosapentaenoate, (11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z,17Z)-eicosapentaenoate, (11R)-hydroxy-(5Z,8Z,12E,14Z,17Z)-icosapentaenoate, (5Z,8Z,11R,12E,14Z,17Z)-11-hydroxyicosapentaenoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:90820 · EMBL-EBI · CC BY 4.0