Биотрансформация веществ
5-HPETE(1-)
5-HPETE(1-) — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «HPETE anion». Для неё указаны формула C20H31O4 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H31O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 31, O — 4. Средняя масса составляет 335.464 Да, а моноизотопная масса — 335.22278 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-HPETE(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H31O4 это приблизительно 3,35464 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-HPETE(1-) — сопряжённое основание для «5-HPETE». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-HPETE(1-)
- Класс ChEBI
- HPETE anion
- Формула
- C20H31O4
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 335.464
- Моноизотопная масса, Да
- 335.22278
- InChIKey
- JNUUNUQHXIOFDA-XTDASVJISA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosa-6,8,11,14-tetraenoate, (6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosa-6,8,11,14-tetraenoate, (6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosatetraenoate, 5-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:90822 · EMBL-EBI · CC BY 4.0