Биотрансформация веществ
(7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoate
(7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoate — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxydocosapentaenoate». Для неё указаны формула C22H33O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C22H33O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 22, H — 33, O — 3. Средняя масса составляет 345.503 Да, а моноизотопная масса — 345.24352 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C22H33O3 это приблизительно 3,45503 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoate — сопряжённое основание для «(7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (7Z,10Z,13R,14E,16Z,19Z)-13-hydroxydocosapentaenoate
- Класс ChEBI
- hydroxydocosapentaenoate
- Формула
- C22H33O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 345.503
- Моноизотопная масса, Да
- 345.24352
- InChIKey
- FYXSGJODUCMLMK-RFPXNJKWSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 13R-HDPA(1-), 13R-hydroxy-(7Z,10Z,14E,16Z,19Z)-docosapentaenoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:90824 · EMBL-EBI · CC BY 4.0