Биотрансформация веществ
5-HPETE
5-HPETE — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «HPETE». Для неё указаны формула C20H32O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H32O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 32, O — 4. Средняя масса составляет 336.472 Да, а моноизотопная масса — 336.23006 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-HPETE равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H32O4 это приблизительно 3,36472 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-HPETE — сопряжённая кислота для «5-HPETE(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-HPETE
- Класс ChEBI
- HPETE
- Формула
- C20H32O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 336.472
- Моноизотопная масса, Да
- 336.23006
- InChIKey
- JNUUNUQHXIOFDA-XTDASVJISA-N
- CAS RN
- 74581-83-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosatetraenoic acid, 5-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoic acid, 5-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-icosatetraenoic acid, 6,8,11,14-Eicosatetraenoic acid 5-hydroperoxide
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:91268 · EMBL-EBI · CC BY 4.0