Клиническая биохимия
skatole
skatole — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «methylindole». Для неё указаны формула C9H9N и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C9H9N задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 9, H — 9, N — 1. Средняя масса составляет 131.178 Да, а моноизотопная масса — 131.0735 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание skatole равно 10 мкмоль/л, то для формы C9H9N это приблизительно 1,31178 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название skatole и формулу C9H9N, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- skatole
- Класс ChEBI
- methylindole
- Формула
- C9H9N
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 131.178
- Моноизотопная масса, Да
- 131.0735
- InChIKey
- ZFRKQXVRDFCRJG-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 83-34-1
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-methyl-1H-indole, 3-methyl-1H-indole, 3-methyl-4,5-benzopyrrole, 3-Methylindole
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:9171 · EMBL-EBI · CC BY 4.0