Физиом

Физиом — совокупность физиологических функций организма. Термин происходит от "physio-" (природа) и "-ome" (в целом). Физиом описывает физиологическую динамику нормального здорового организма, основываясь на информации о его структуре (геном, протеом, и morphome).

Основные принципы

На основании обобщения опыта предыдущих лет развития проекта «Физиом» были сформулированы следующие новые принципы.

Как один из основных принципов проекта «Физиом» был указан интегративный подход. Термин «интеграционизм» (англ.: integrationism) был предложен в 2000 г. для обозначения интегративного подхода, сочетающего преимущества и редукционизма, и холизма. В 2018 г. было предложено понимать интегративный подход (интегративизм) в математической физике биологических объектов как разумное сочетание преимуществ редукционизма и холизма в решении задач биологии методами математической физики. В начале XXI века возникло новое научное течение, обозначенное как интегративная физиология, — которая, как ожидается, должна стать «очень количественной» (англ.: «highly quantitative») и, следовательно, одной из наиболее компьютеризованных дисциплин.

Необходимость «многоуровневого рассмотрения» (англ. multiscale analysis) в качестве одного из центральных принципов проекта «Физиом». Под ней понимают то, что сложные системы, такие как сердце, «неизбежно состоят из элементов различной природы, пространственно выстроенных в иерархическую структуру», — что требует сочетания разных типов моделирования, используемых на разных уровнях организации биосистемы, поскольку «попытки моделировать на уровне органов и систем так же, как на молекулярном и клеточном уровнях, невозможны и не приводят к пониманию». «Анализ сверху донизу сам по себе недостаточен, и это, следовательно, является ещё одним оправданием для подхода среднего уровня» (англ. middle-out approach).

Пример

Например, при инфаркте и замещении нормального миокарда рубцом ткань теряет способность сжиматься и потому действует как пассивный эластичный материал — и это потребует произвести локально смену математической модели для описания новой ситуации.

Связанные термины

В энциклопедии ИНФОМЕД