Клиническая биохимия
isopentenyl diphosphate(3-)
isopentenyl diphosphate(3-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «organophosphate oxoanion». Для неё указаны формула C5H9O7P2 и формальный заряд -3.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H9O7P2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 9, O — 7, P — 2. Средняя масса составляет 243.068 Да, а моноизотопная масса — 242.984 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание isopentenyl diphosphate(3-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H9O7P2 это приблизительно 2,43068 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: isopentenyl diphosphate(3-) — сопряжённое основание для «isopentenyl diphosphate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- isopentenyl diphosphate(3-)
- Класс ChEBI
- organophosphate oxoanion
- Формула
- C5H9O7P2
- Формальный заряд
- -3
- Средняя масса, Да
- 243.068
- Моноизотопная масса, Да
- 242.984
- InChIKey
- NUHSROFQTUXZQQ-UHFFFAOYSA-K
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-methylbut-3-en-1-yl diphosphate, 3-methylbut-3-en-1-yl diphosphate, 3-methylbut-3-enyl diphosphate, 3-methylbut-3-enyl diphosphate trianion
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:128769 · EMBL-EBI · CC BY 4.0