Клиническая биохимия
3',5'-cyclic AMP(1-)
3',5'-cyclic AMP(1-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «organophosphate oxoanion». Для неё указаны формула C10H11N5O6P и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H11N5O6P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 11, N — 5, O — 6, P — 1. Средняя масса составляет 328.201 Да, а моноизотопная масса — 328.04524 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3',5'-cyclic AMP(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H11N5O6P это приблизительно 3,28201 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3',5'-cyclic AMP(1-) — сопряжённое основание для «3',5'-cyclic AMP». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3',5'-cyclic AMP(1-)
- Класс ChEBI
- organophosphate oxoanion
- Формула
- C10H11N5O6P
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 328.201
- Моноизотопная масса, Да
- 328.04524
- InChIKey
- IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 3',5'-cyclic AMP, 3',5'-cyclic AMP anion, adenosine 3',5'-cyclic monophosphate, adenosine 3',5'-cyclic monophosphate anion
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:58165 · EMBL-EBI · CC BY 4.0