Клиническая биохимия
Asp-Tyr-Met-Gly-Trp-Met-Asp-Phe-NH2
Asp-Tyr-Met-Gly-Trp-Met-Asp-Phe-NH2 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «peptidyl amide». Для неё указаны формула C49H62N10O13S2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C49H62N10O13S2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 49, H — 62, N — 10, O — 13, S — 2. Средняя масса составляет 1063.226 Да, а моноизотопная масса — 1062.39392 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание Asp-Tyr-Met-Gly-Trp-Met-Asp-Phe-NH2 равно 10 мкмоль/л, то для формы C49H62N10O13S2 это приблизительно 10,63226 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «peptidyl amide» описано другое соединение — mastoparan-AF с формулой C72H127N19O15. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- Asp-Tyr-Met-Gly-Trp-Met-Asp-Phe-NH2
- Класс ChEBI
- peptidyl amide
- Формула
- C49H62N10O13S2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1063.226
- Моноизотопная масса, Да
- 1062.39392
- InChIKey
- OIXQINQYMGNCII-YRVFCXMDSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- desulfated CCK-8, desulfated cholecystokinin-8, desulfated sincalide, DYMGWMDF-NH2
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:138169 · EMBL-EBI · CC BY 4.0