Клиническая биохимия
p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe
p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «polypeptide». Для неё указаны формула C69H108N22O16S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C69H108N22O16S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 69, H — 108, N — 22, O — 16, S — 1. Средняя масса составляет 1533.828 Да, а моноизотопная масса — 1532.80344 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe равно 10 мкмоль/л, то для формы C69H108N22O16S это приблизительно 15,33828 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe — таутомер соединения «[Pyr1]apelin-13(2+)». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe
- Класс ChEBI
- polypeptide
- Формула
- C69H108N22O16S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1533.828
- Моноизотопная масса, Да
- 1532.80344
- InChIKey
- GGMAXEWLXWJGSF-PEWBXTNBSA-N
- CAS RN
- 217082-60-5
- Другие обозначения в ChEBI
- (pGlu1)apelin-13, [Pyr1]-apelin-13, [Pyr1]apelin-13
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:138186 · EMBL-EBI · CC BY 4.0