Клиническая биохимия
ghrelin
ghrelin — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «polypeptide». Для неё указаны формула C149H249N47O42 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C149H249N47O42 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 149, H — 249, N — 47, O — 42. Средняя масса составляет 3370.918 Да, а моноизотопная масса — 3368.87933 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание ghrelin равно 10 мкмоль/л, то для формы C149H249N47O42 это приблизительно 33,70918 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «polypeptide» описано другое соединение — p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe с формулой C69H108N22O16S. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- ghrelin
- Класс ChEBI
- polypeptide
- Формула
- C149H249N47O42
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 3370.918
- Моноизотопная масса, Да
- 3368.87933
- InChIKey
- GNKDKYIHGQKHHM-RJKLHVOGSA-N
- CAS RN
- 258279-04-8
- Другие обозначения в ChEBI
- Gastric MLTRP, Ghrelin (human), GS-S(n-octanoyl)-FLSPEHQRVQQRKESKKPPAKLQPR
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:75431 · EMBL-EBI · CC BY 4.0