Клиническая биохимия
nociceptin
nociceptin — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «polypeptide». Для неё указаны формула C79H129N27O22 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C79H129N27O22 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 79, H — 129, N — 27, O — 22. Средняя масса составляет 1809.068 Да, а моноизотопная масса — 1807.98055 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание nociceptin равно 10 мкмоль/л, то для формы C79H129N27O22 это приблизительно 18,09068 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «polypeptide» описано другое соединение — p-Glu-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe с формулой C69H108N22O16S. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- nociceptin
- Класс ChEBI
- polypeptide
- Формула
- C79H129N27O22
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1809.068
- Моноизотопная масса, Да
- 1807.98055
- InChIKey
- PULGYDLMFSFVBL-SMFNREODSA-N
- CAS RN
- 170713-75-4
- Другие обозначения в ChEBI
- FGGFTGARKSARKLANQ, Nociceptin (1-17), Nociceptin (1-17)
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:80266 · EMBL-EBI · CC BY 4.0