Клиническая биохимия
2-methylcitrate(3-)
2-methylcitrate(3-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «tricarboxylic acid trianion». Для неё указаны формула C7H7O7 и формальный заряд -3.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H7O7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 7, O — 7. Средняя масса составляет 203.126 Да, а моноизотопная масса — 203.02082 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-methylcitrate(3-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H7O7 это приблизительно 2,03126 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-methylcitrate(3-) — сопряжённое основание для «2-methylcitric acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-methylcitrate(3-)
- Класс ChEBI
- tricarboxylic acid trianion
- Формула
- C7H7O7
- Формальный заряд
- -3
- Средняя масса, Да
- 203.126
- Моноизотопная масса, Да
- 203.02082
- InChIKey
- YNOXCRMFGMSKIJ-UHFFFAOYSA-K
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-Hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate, 2-hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate, 2-hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate, 2-Methylcitrate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15598 · EMBL-EBI · CC BY 4.0