Клиническая биохимия
isocitrate(3-)
isocitrate(3-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «tricarboxylic acid trianion». Для неё указаны формула C6H5O7 и формальный заряд -3.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H5O7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 5, O — 7. Средняя масса составляет 189.099 Да, а моноизотопная масса — 189.00517 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание isocitrate(3-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H5O7 это приблизительно 1,89099 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: isocitrate(3-) — сопряжённое основание для «isocitrate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- isocitrate(3-)
- Класс ChEBI
- tricarboxylic acid trianion
- Формула
- C6H5O7
- Формальный заряд
- -3
- Средняя масса, Да
- 189.099
- Моноизотопная масса, Да
- 189.00517
- InChIKey
- ODBLHEXUDAPZAU-UHFFFAOYSA-K
- Другие обозначения в ChEBI
- 1-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylate, 1-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylate, 1-hydroxytricarballylate, 3-carboxylato-2,3-dideoxypentarate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16087 · EMBL-EBI · CC BY 4.0