Клиническая биохимия
3-mercaptopentanol
3-mercaptopentanol — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «первичные спирты». Для неё указаны формула C5H12OS и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H12OS задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 12, O — 1, S — 1. Средняя масса составляет 120.217 Да, а моноизотопная масса — 120.06089 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-mercaptopentanol равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H12OS это приблизительно 1,20217 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C5H12OS — 2-methyl-3-sulfanylbutan-1-ol. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 3-mercaptopentanol
- Класс ChEBI
- primary alcohol
- Формула
- C5H12OS
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 120.217
- Моноизотопная масса, Да
- 120.06089
- InChIKey
- PRJACVDGNSZBLE-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 548740-99-4
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-mercapto-1-pentanol, 3-mercaptopentan-1-ol, 3-sulfanyl-1-pentanol, 3-sulfanyl-1-pentanol
- Химическая группа
- первичные спирты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:156144 · EMBL-EBI · CC BY 4.0