Клиническая биохимия
5-hydroxymethyluracil
5-hydroxymethyluracil — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «первичные спирты». Для неё указаны формула C5H6N2O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H6N2O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 6, N — 2, O — 3. Средняя масса составляет 142.114 Да, а моноизотопная масса — 142.03784 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-hydroxymethyluracil равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H6N2O3 это приблизительно 1,42114 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «primary alcohol» описано другое соединение — N-ethyldiethanolamine с формулой C6H15NO2. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- 5-hydroxymethyluracil
- Класс ChEBI
- primary alcohol
- Формула
- C5H6N2O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 142.114
- Моноизотопная масса, Да
- 142.03784
- InChIKey
- JDBGXEHEIRGOBU-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 4433-40-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 5-(hydroxymethyl)-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione, 5-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione, 5-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione, 5-(hydroxymethyl)uracil
- Химическая группа
- первичные спирты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16964 · EMBL-EBI · CC BY 4.0