Клиническая биохимия
formate
formate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «анионы монокарбоновых кислот». Для неё указаны формула CHO2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула CHO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 1, H — 1, O — 2. Средняя масса составляет 45.017 Да, а моноизотопная масса — 44.9982 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание formate равно 10 мкмоль/л, то для формы CHO2 это приблизительно 0,45017 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: formate — сопряжённое основание для «formic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- formate
- Класс ChEBI
- monocarboxylic acid anion
- Формула
- CHO2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 45.017
- Моноизотопная масса, Да
- 44.9982
- InChIKey
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-M
- CAS RN
- 71-47-6
- Другие обозначения в ChEBI
- aminate, formiate, formic acid, ion(1-)
- Химическая группа
- анионы монокарбоновых кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15740 · EMBL-EBI · CC BY 4.0