Клиническая биохимия
allantoate
allantoate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «анионы монокарбоновых кислот». Для неё указаны формула C4H7N4O4 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H7N4O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 7, N — 4, O — 4. Средняя масса составляет 175.124 Да, а моноизотопная масса — 175.04728 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание allantoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H7N4O4 это приблизительно 1,75124 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: allantoate — сопряжённое основание для «allantoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- allantoate
- Класс ChEBI
- monocarboxylic acid anion
- Формула
- C4H7N4O4
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 175.124
- Моноизотопная масса, Да
- 175.04728
- InChIKey
- NUCLJNSWZCHRKL-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 2,2-bis(aminocarbonylamino)ethanoate, allantoate ion, bis(carbamoylamino)acetate, bis(carbamoylamino)acetate
- Химическая группа
- анионы монокарбоновых кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17536 · EMBL-EBI · CC BY 4.0