Клиническая биохимия
urocanate
urocanate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «анионы монокарбоновых кислот». Для неё указаны формула C6H5N2O2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H5N2O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 5, N — 2, O — 2. Средняя масса составляет 137.118 Да, а моноизотопная масса — 137.03565 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание urocanate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H5N2O2 это приблизительно 1,37118 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: urocanate — сопряжённое основание для «urocanic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- urocanate
- Класс ChEBI
- monocarboxylic acid anion
- Формула
- C6H5N2O2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 137.118
- Моноизотопная масса, Да
- 137.03565
- InChIKey
- LOIYMIARKYCTBW-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-(1H-imidazol-4-yl)prop-2-enoate, 3-(1H-imidazol-4-yl)prop-2-enoate
- Химическая группа
- анионы монокарбоновых кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27247 · EMBL-EBI · CC BY 4.0