Клиническая биохимия
N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate
N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «N-acyl-D-glucosamine 6-phosphate». Для неё указаны формула C8H16NO9P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H16NO9P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 16, N — 1, O — 9, P — 1. Средняя масса составляет 301.188 Да, а моноизотопная масса — 301.05627 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H16NO9P это приблизительно 3,01188 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate — сопряжённая кислота для «N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- N-acetyl-D-glucosamine 6-phosphate
- Класс ChEBI
- N-acyl-D-glucosamine 6-phosphate
- Формула
- C8H16NO9P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 301.188
- Моноизотопная масса, Да
- 301.05627
- InChIKey
- BRGMHAYQAZFZDJ-RTRLPJTCSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-acetamido-2-deoxy-6-O-phosphono-D-glucopyranose
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15784 · EMBL-EBI · CC BY 4.0