Клиническая биохимия
3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine
3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine». Для неё указаны формула C9H21N2O3 и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C9H21N2O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 9, H — 21, N — 2, O — 3. Средняя масса составляет 205.278 Да, а моноизотопная масса — 205.15467 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine равно 10 мкмоль/л, то для формы C9H21N2O3 это приблизительно 2,05278 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine — таутомер соединения «3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- 3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine
- Класс ChEBI
- N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysine
- Формула
- C9H21N2O3
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 205.278
- Моноизотопная масса, Да
- 205.15467
- InChIKey
- ZRJHLGYVUCPZNH-MQWKRIRWSA-O
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysin-N(6)-ium, 3-hydroxy-N(6),N(6),N(6)-trimethyl-L-lysin-N(6)-ium, 3-Hydroxy-N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15786 · EMBL-EBI · CC BY 4.0