Клиническая биохимия
alpha-D-glucosamine 6-phosphate
alpha-D-glucosamine 6-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose 6-phosphate». Для неё указаны формула C6H14NO8P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H14NO8P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 14, N — 1, O — 8, P — 1. Средняя масса составляет 259.151 Да, а моноизотопная масса — 259.0457 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание alpha-D-glucosamine 6-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H14NO8P это приблизительно 2,59151 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: alpha-D-glucosamine 6-phosphate — сопряжённая кислота для «alpha-D-glucosamine 6-phosphate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- alpha-D-glucosamine 6-phosphate
- Класс ChEBI
- 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose 6-phosphate
- Формула
- C6H14NO8P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 259.151
- Моноизотопная масса, Да
- 259.0457
- InChIKey
- XHMJOUIAFHJHBW-UKFBFLRUSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-amino-2-deoxy-6-O-phosphono-alpha-D-glucopyranose, alpha-D-glucosamine 6-(dihydrogen phosphate), GLUCOSAMINE 6-PHOSPHATE
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15873 · EMBL-EBI · CC BY 4.0