Клиническая биохимия
5-aminopentanoic acid
5-aminopentanoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «delta-amino acid». Для неё указаны формула C5H11NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H11NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 11, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 117.148 Да, а моноизотопная масса — 117.07898 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-aminopentanoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H11NO2 это приблизительно 1,17148 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-aminopentanoic acid — сопряжённая кислота для «5-aminopentanoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-aminopentanoic acid
- Класс ChEBI
- delta-amino acid
- Формула
- C5H11NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 117.148
- Моноизотопная масса, Да
- 117.07898
- InChIKey
- JJMDCOVWQOJGCB-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 660-88-8
- Другие обозначения в ChEBI
- 5-amino-n-valeric acid, 5-amino-pentanoic acid, 5-Aminopentanoate, 5-Aminopentanoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15887 · EMBL-EBI · CC BY 4.0