Клиническая биохимия
sn-glycerol 3-phosphate
sn-glycerol 3-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «glycerol 1-phosphate». Для неё указаны формула C3H9O6P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H9O6P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 9, O — 6, P — 1. Средняя масса составляет 172.073 Да, а моноизотопная масса — 172.01367 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание sn-glycerol 3-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H9O6P это приблизительно 1,72073 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: sn-glycerol 3-phosphate — сопряжённая кислота для «sn-glycerol 3-phosphate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- sn-glycerol 3-phosphate
- Класс ChEBI
- glycerol 1-phosphate
- Формула
- C3H9O6P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 172.073
- Моноизотопная масса, Да
- 172.01367
- InChIKey
- AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N
- CAS RN
- 17989-41-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R)-2,3-dihydroxypropyl dihydrogen phosphate, (2R)-2,3-dihydroxypropyl dihydrogen phosphate, (R)-glycerol 1-phosphate, D-(glycerol 1-phosphate)
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15978 · EMBL-EBI · CC BY 4.0