Клиническая биохимия
cob(I)alamin
cob(I)alamin — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «cobalamin». Для неё указаны формула C62H89CoN13O14P и формальный заряд 0. Другие роли, приведённые для той же структуры: кофактор.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C62H89CoN13O14P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 62, H — 89, Co — 1, N — 13, O — 14, P — 1. Средняя масса составляет 1330.378 Да, а моноизотопная масса — 1329.57215 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание cob(I)alamin равно 10 мкмоль/л, то для формы C62H89CoN13O14P это приблизительно 13,30378 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: cob(I)alamin — сопряжённая кислота для «cob(I)alamin(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- cob(I)alamin
- Класс ChEBI
- cobalamin
- Формула
- C62H89CoN13O14P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1330.378
- Моноизотопная масса, Да
- 1329.57215
- InChIKey
- OMAOKVYASDIYQG-DSRCUDDDSA-M
- CAS RN
- 18534-66-2
- Другие обозначения в ChEBI
- vitamin B-12s, Vitamin B12s
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:15982 · EMBL-EBI · CC BY 4.0