Клиническая биохимия
cis-aconitate(3-)
cis-aconitate(3-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «aconitate(3-)». Для неё указаны формула C6H3O6 и формальный заряд -3.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H3O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 3, O — 6. Средняя масса составляет 171.084 Да, а моноизотопная масса — 170.99461 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание cis-aconitate(3-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H3O6 это приблизительно 1,71084 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: cis-aconitate(3-) — сопряжённое основание для «cis-aconitic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- cis-aconitate(3-)
- Класс ChEBI
- aconitate(3-)
- Формула
- C6H3O6
- Формальный заряд
- -3
- Средняя масса, Да
- 171.084
- Моноизотопная масса, Да
- 170.99461
- InChIKey
- GTZCVFVGUGFEME-IWQZZHSRSA-K
- Другие обозначения в ChEBI
- (1Z)-prop-1-ene-1,2,3-tricarboxylate, (1Z)-prop-1-ene-1,2,3-tricarboxylate, Cis-aconitate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16383 · EMBL-EBI · CC BY 4.0