Клиническая биохимия
5-pyridoxic acid
5-pyridoxic acid — метаболит, отмеченный в моче человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «methylpyridines». Для неё указаны формула C8H9NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
В работе с мочой концентрация в отдельной порции и количество, выделенное за время сбора, отвечают на разные вопросы. При чтении протокола смотрят на единицы, длительность сбора и способ нормирования. Метка биологической роли не сообщает, каким методом определяли соединение.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H9NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 9, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 183.163 Да, а моноизотопная масса — 183.05316 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-pyridoxic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H9NO4 это приблизительно 1,83163 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-pyridoxic acid — сопряжённая кислота для «5-pyridoxate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-pyridoxic acid
- Класс ChEBI
- methylpyridines
- Формула
- C8H9NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 183.163
- Моноизотопная масса, Да
- 183.05316
- InChIKey
- VJZTVPVXKYQRJZ-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 524-07-2
- Другие обозначения в ChEBI
- 5-hydroxy-4-(hydroxymethyl)-6-methylnicotinic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16409 · EMBL-EBI · CC BY 4.0