Клиническая биохимия
pyridoxamine 5'-phosphate
pyridoxamine 5'-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «methylpyridines». Для неё указаны формула C8H13N2O5P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H13N2O5P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 13, N — 2, O — 5, P — 1. Средняя масса составляет 248.175 Да, а моноизотопная масса — 248.05621 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание pyridoxamine 5'-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H13N2O5P это приблизительно 2,48175 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: pyridoxamine 5'-phosphate — сопряжённая кислота для «pyridoxamine 5'-phosphate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- pyridoxamine 5'-phosphate
- Класс ChEBI
- methylpyridines
- Формула
- C8H13N2O5P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 248.175
- Моноизотопная масса, Да
- 248.05621
- InChIKey
- ZMJGSOSNSPKHNH-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 529-96-4
- Другие обозначения в ChEBI
- 4'-DEOXY-4'-AMINOPYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE, pyridoxamine 5'-(dihydrogen phosphate), Pyridoxamine 5'-phosphoric acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18335 · EMBL-EBI · CC BY 4.0