Клиническая биохимия
tryptamine
tryptamine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «tryptamines». Для неё указаны формула C10H12N2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H12N2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 12, N — 2. Средняя масса составляет 160.22 Да, а моноизотопная масса — 160.10005 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание tryptamine равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H12N2 это приблизительно 1,6022 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: tryptamine — сопряжённое основание для «tryptaminium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- tryptamine
- Класс ChEBI
- tryptamines
- Формула
- C10H12N2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 160.22
- Моноизотопная масса, Да
- 160.10005
- InChIKey
- APJYDQYYACXCRM-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 61-54-1
- Другие обозначения в ChEBI
- 1H-indole-3-ethanamine, 2-(1H-INDOL-3-YL)ETHANAMINE, 2-(1H-INDOL-3-YL)ETHANAMINE, 2-(1H-indol-3-yl)ethanamine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16765 · EMBL-EBI · CC BY 4.0