Клиническая биохимия
2-oxobutanoate
2-oxobutanoate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2-oxo monocarboxylic acid anion». Для неё указаны формула C4H5O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H5O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 5, O — 3. Средняя масса составляет 101.081 Да, а моноизотопная масса — 101.02442 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-oxobutanoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H5O3 это приблизительно 1,01081 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-oxobutanoate — сопряжённое основание для «2-oxobutanoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-oxobutanoate
- Класс ChEBI
- 2-oxo monocarboxylic acid anion
- Формула
- C4H5O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 101.081
- Моноизотопная масса, Да
- 101.02442
- InChIKey
- TYEYBOSBBBHJIV-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-Ketobutanoate, 2-ketobutyrate, 2-Oxobutyrate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16763 · EMBL-EBI · CC BY 4.0