Клиническая биохимия
4-fumarylacetoacetate(2-)
4-fumarylacetoacetate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «dicarboxylic acid dianion». Для неё указаны формула C8H6O6 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H6O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 6, O — 6. Средняя масса составляет 198.13 Да, а моноизотопная масса — 198.01754 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 4-fumarylacetoacetate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H6O6 это приблизительно 1,9813 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 4-fumarylacetoacetate(2-) — сопряжённое основание для «4-fumarylacetoacetic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 4-fumarylacetoacetate(2-)
- Класс ChEBI
- dicarboxylic acid dianion
- Формула
- C8H6O6
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 198.13
- Моноизотопная масса, Да
- 198.01754
- InChIKey
- GACSIVHAIFQKTC-OWOJBTEDSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-4,6-dioxooct-2-enedioate, (2E)-4,6-dioxooct-2-enedioate, 4-fumarylacetoacetate, 4-fumarylacetoacetate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18034 · EMBL-EBI · CC BY 4.0