Клиническая биохимия
N-formimidoyl-L-glutamate(2-)
N-formimidoyl-L-glutamate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «dicarboxylic acid dianion». Для неё указаны формула C6H8N2O4 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H8N2O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 8, N — 2, O — 4. Средняя масса составляет 172.14 Да, а моноизотопная масса — 172.0495 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание N-formimidoyl-L-glutamate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H8N2O4 это приблизительно 1,7214 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: N-formimidoyl-L-glutamate(2-) — сопряжённое основание для «N-formimidoyl-L-glutamic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- N-formimidoyl-L-glutamate(2-)
- Класс ChEBI
- dicarboxylic acid dianion
- Формула
- C6H8N2O4
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 172.14
- Моноизотопная масса, Да
- 172.0495
- InChIKey
- NRXIKWMTVXPVEF-BYPYZUCNSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-(methanimidamido)pentanedioate, (2S)-2-(methanimidamido)pentanedioate, N-methanimidoyl-L-glutamate, N-methanimidoyl-L-glutamate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18327 · EMBL-EBI · CC BY 4.0