Клиническая биохимия
3-phosphonatooxypyruvate(3-)
3-phosphonatooxypyruvate(3-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «carboxyalkyl phosphate oxoanion». Для неё указаны формула C3H2O7P и формальный заряд -3.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C3H2O7P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 3, H — 2, O — 7, P — 1. Средняя масса составляет 181.016 Да, а моноизотопная масса — 180.95546 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-phosphonatooxypyruvate(3-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C3H2O7P это приблизительно 1,81016 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-phosphonatooxypyruvate(3-) — сопряжённое основание для «3-phosphonooxypyruvic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-phosphonatooxypyruvate(3-)
- Класс ChEBI
- carboxyalkyl phosphate oxoanion
- Формула
- C3H2O7P
- Формальный заряд
- -3
- Средняя масса, Да
- 181.016
- Моноизотопная масса, Да
- 180.95546
- InChIKey
- LFLUCDOSQPJJBE-UHFFFAOYSA-K
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-oxo-3-(phosphonatooxy)propanoate, 2-oxo-3-(phosphonatooxy)propanoate, 3-Phosphohydroxypyruvate, 3-Phosphonooxypyruvate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:18110 · EMBL-EBI · CC BY 4.0