Клиническая биохимия
glutaconic acid
glutaconic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «pentenedioic acid». Для неё указаны формула C5H6O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H6O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 6, O — 4. Средняя масса составляет 130.099 Да, а моноизотопная масса — 130.02661 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание glutaconic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H6O4 это приблизительно 1,30099 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: glutaconic acid — сопряжённая кислота для «glutaconate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- glutaconic acid
- Класс ChEBI
- pentenedioic acid
- Формула
- C5H6O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 130.099
- Моноизотопная масса, Да
- 130.02661
- InChIKey
- XVOUMQNXTGKGMA-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 1724-02-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-Pentenedioic acid, Pent-2-ene-1,5-dioic acid, pent-2-enedioic acid, pent-2-enedioic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:24309 · EMBL-EBI · CC BY 4.0