Клиническая биохимия
indole-3-carboxylic acid
indole-3-carboxylic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indol-3-yl carboxylic acid». Для неё указаны формула C9H7NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C9H7NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 9, H — 7, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 161.16 Да, а моноизотопная масса — 161.04768 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание indole-3-carboxylic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C9H7NO2 это приблизительно 1,6116 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: indole-3-carboxylic acid — сопряжённая кислота для «indole-3-carboxylate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- indole-3-carboxylic acid
- Класс ChEBI
- indol-3-yl carboxylic acid
- Формула
- C9H7NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 161.16
- Моноизотопная масса, Да
- 161.04768
- InChIKey
- KMAKOBLIOCQGJP-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 771-50-6
- Другие обозначения в ChEBI
- 1H-indole-3-carboxylic acid, 1H-indole-3-carboxylic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:24809 · EMBL-EBI · CC BY 4.0