Клиническая биохимия
3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid
3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indol-3-yl carboxylic acid». Для неё указаны формула C11H11NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H11NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 11, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 189.214 Да, а моноизотопная масса — 189.07898 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H11NO2 это приблизительно 1,89214 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid — сопряжённая кислота для «3-(1H-indol-3-yl)propanoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid
- Класс ChEBI
- indol-3-yl carboxylic acid
- Формула
- C11H11NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 189.214
- Моноизотопная масса, Да
- 189.07898
- InChIKey
- GOLXRNDWAUTYKT-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 830-96-6
- Другие обозначения в ChEBI
- beta-(3-Indolyl)propionic acid, Indole-3-propionic acid, Indolepropionic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:43580 · EMBL-EBI · CC BY 4.0