Клиническая биохимия
trans-oct-2-enoyl-CoA
trans-oct-2-enoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «monounsaturated fatty acyl-CoA». Для неё указаны формула C29H48N7O17P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C29H48N7O17P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 29, H — 48, N — 7, O — 17, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 891.724 Да, а моноизотопная масса — 891.20402 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание trans-oct-2-enoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C29H48N7O17P3S это приблизительно 8,91724 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: trans-oct-2-enoyl-CoA — сопряжённая кислота для «trans-oct-2-enoyl-CoA(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- trans-oct-2-enoyl-CoA
- Класс ChEBI
- monounsaturated fatty acyl-CoA
- Формула
- C29H48N7O17P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 891.724
- Моноизотопная масса, Да
- 891.20402
- InChIKey
- CPSDNAXXKWVYIY-NTLMCJQISA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-Octenoyl-CoA, (2E)-octenoyl-coenzyme A, 2,3-trans-octenoyl coenzyme A, 2E-octenoyl-CoA
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:27537 · EMBL-EBI · CC BY 4.0