Клиническая биохимия
trans-hex-2-enoyl-CoA
trans-hex-2-enoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «monounsaturated fatty acyl-CoA». Для неё указаны формула C27H44N7O17P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C27H44N7O17P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 27, H — 44, N — 7, O — 17, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 863.67 Да, а моноизотопная масса — 863.17272 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание trans-hex-2-enoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C27H44N7O17P3S это приблизительно 8,6367 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: trans-hex-2-enoyl-CoA — сопряжённая кислота для «trans-hex-2-enoyl-CoA(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- trans-hex-2-enoyl-CoA
- Класс ChEBI
- monounsaturated fatty acyl-CoA
- Формула
- C27H44N7O17P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 863.67
- Моноизотопная масса, Да
- 863.17272
- InChIKey
- OINXHIBNZUUIMR-IXUYQXAASA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-Hexenoyl-CoA, (2E)-hexenoyl-coenzyme A, 2E-hexenoyl-CoA, 2E-hexenoyl-coenzyme A
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28706 · EMBL-EBI · CC BY 4.0