Клиническая биохимия
6-oxoprostaglandin F1alpha
6-oxoprostaglandin F1alpha — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandins Falpha». Для неё указаны формула C20H34O6 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H34O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 34, O — 6. Средняя масса составляет 370.486 Да, а моноизотопная масса — 370.23554 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 6-oxoprostaglandin F1alpha равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H34O6 это приблизительно 3,70486 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 6-oxoprostaglandin F1alpha — сопряжённая кислота для «6-oxoprostaglandin F1alpha(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 6-oxoprostaglandin F1alpha
- Класс ChEBI
- prostaglandins Falpha
- Формула
- C20H34O6
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 370.486
- Моноизотопная масса, Да
- 370.23554
- InChIKey
- KFGOFTHODYBSGM-ZUNNJUQCSA-N
- CAS RN
- 58962-34-8
- Другие обозначения в ChEBI
- 6-Keto-PGF1a, 6-Keto-PGF1alpha, 6-Keto-prostaglandin F1a, 6-Keto-prostaglandin F1alpha
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28158 · EMBL-EBI · CC BY 4.0