Клиническая биохимия
(S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA
(S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxy fatty acyl-CoA». Для неё указаны формула C27H46N7O18P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C27H46N7O18P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 27, H — 46, N — 7, O — 18, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 881.685 Да, а моноизотопная масса — 881.18329 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C27H46N7O18P3S это приблизительно 8,81685 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA — сопряжённая кислота для «(S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (S)-3-hydroxyhexanoyl-CoA
- Класс ChEBI
- hydroxy fatty acyl-CoA
- Формула
- C27H46N7O18P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 881.685
- Моноизотопная масса, Да
- 881.18329
- InChIKey
- VAAHKRMGOFIORX-IKTBLOROSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (S)-3-hydroxycaproyl-CoA, (S)-3-hydroxycaproyl-coenzyme A, (S)-Hydroxyhexanoyl-CoA
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28276 · EMBL-EBI · CC BY 4.0