Клиническая биохимия
5-methoxyindole-3-acetic acid
5-methoxyindole-3-acetic acid — метаболит, отмеченный в моче человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indole-3-acetic acids». Для неё указаны формула C11H11NO3 и формальный заряд 0. Другие роли, приведённые для той же структуры: антибактериальный агент.
Что означает эта роль
В работе с мочой концентрация в отдельной порции и количество, выделенное за время сбора, отвечают на разные вопросы. При чтении протокола смотрят на единицы, длительность сбора и способ нормирования. Метка биологической роли не сообщает, каким методом определяли соединение.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H11NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 11, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 205.213 Да, а моноизотопная масса — 205.07389 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-methoxyindole-3-acetic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H11NO3 это приблизительно 2,05213 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C11H11NO3 — 3-(indol-3-yl)lactic acid. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 5-methoxyindole-3-acetic acid
- Класс ChEBI
- indole-3-acetic acids
- Формула
- C11H11NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 205.213
- Моноизотопная масса, Да
- 205.07389
- InChIKey
- COCNDHOPIHDTHK-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 3471-31-6
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)acetic acid, 2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)acetic acid, 2-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)ethanoic acid, 2-(5-methoxyindole-3-yl)acetic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28281 · EMBL-EBI · CC BY 4.0