Клиническая биохимия
indole-3-acetic acid
indole-3-acetic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indole-3-acetic acids». Для неё указаны формула C10H9NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H9NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 9, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 175.187 Да, а моноизотопная масса — 175.06333 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание indole-3-acetic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H9NO2 это приблизительно 1,75187 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: indole-3-acetic acid — сопряжённая кислота для «indole-3-acetate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- indole-3-acetic acid
- Класс ChEBI
- indole-3-acetic acids
- Формула
- C10H9NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 175.187
- Моноизотопная масса, Да
- 175.06333
- InChIKey
- SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 87-51-4
- Другие обозначения в ChEBI
- (Indol-3-yl)acetate, 1H-indol-3-ylacetic acid, 1H-indol-3-ylacetic acid, 2-(indol-3-yl)ethanoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16411 · EMBL-EBI · CC BY 4.0