Клиническая биохимия
(S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA
(S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «(S)-3-hydroxyacyl-CoA». Для неё указаны формула C29H50N7O18P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C29H50N7O18P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 29, H — 50, N — 7, O — 18, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 909.739 Да, а моноизотопная масса — 909.21459 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C29H50N7O18P3S это приблизительно 9,09739 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA — сопряжённая кислота для «(S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA(4-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (S)-3-hydroxyoctanoyl-CoA
- Класс ChEBI
- (S)-3-hydroxyacyl-CoA
- Формула
- C29H50N7O18P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 909.739
- Моноизотопная масса, Да
- 909.21459
- InChIKey
- ATVGTMKWKDUCMS-OTOYJEMWSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (S)-3-Hydroxycapryloyl-CoA, (S)-3-hydroxycapryloyl-coenzyme A, (S)-3-hydroxyoctanoyl-coenzyme A, (S)-Hydroxyoctanoyl-CoA
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28632 · EMBL-EBI · CC BY 4.0