Клиническая биохимия
D-glucarate(2-)
D-glucarate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «glucarate(2-)». Для неё указаны формула C6H8O8 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H8O8 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 8, O — 8. Средняя масса составляет 208.122 Да, а моноизотопная масса — 208.02301 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание D-glucarate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H8O8 это приблизительно 2,08122 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: D-glucarate(2-) — сопряжённое основание для «D-glucarate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- D-glucarate(2-)
- Класс ChEBI
- glucarate(2-)
- Формула
- C6H8O8
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 208.122
- Моноизотопная масса, Да
- 208.02301
- InChIKey
- DSLZVSRJTYRBFB-LLEIAEIESA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R,3S,4S,5S)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexanedioate, (2R,3S,4S,5S)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexanedioate, D-GLUCARATE, D-GLUCARATE
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:30612 · EMBL-EBI · CC BY 4.0