Клиническая биохимия
L-pipecolate
L-pipecolate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «pipecolate». Для неё указаны формула C6H10NO2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H10NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 10, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 128.151 Да, а моноизотопная масса — 128.0717 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-pipecolate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H10NO2 это приблизительно 1,28151 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-pipecolate — сопряжённое основание для «L-pipecolic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-pipecolate
- Класс ChEBI
- pipecolate
- Формула
- C6H10NO2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 128.151
- Моноизотопная масса, Да
- 128.0717
- InChIKey
- HXEACLLIILLPRG-YFKPBYRVSA-M
- CAS RN
- 3105-95-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-piperidine-2-carboxylate, (2S)-piperidine-2-carboxylate, (S)-pipecolate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:30633 · EMBL-EBI · CC BY 4.0