Клиническая биохимия
(R)-2-hydroxyglutaric acid
(R)-2-hydroxyglutaric acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2-hydroxyglutaric acid». Для неё указаны формула C5H8O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H8O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 8, O — 5. Средняя масса составляет 148.114 Да, а моноизотопная масса — 148.03717 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (R)-2-hydroxyglutaric acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H8O5 это приблизительно 1,48114 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (R)-2-hydroxyglutaric acid — сопряжённая кислота для «(R)-2-hydroxyglutarate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (R)-2-hydroxyglutaric acid
- Класс ChEBI
- 2-hydroxyglutaric acid
- Формула
- C5H8O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 148.114
- Моноизотопная масса, Да
- 148.03717
- InChIKey
- HWXBTNAVRSUOJR-GSVOUGTGSA-N
- CAS RN
- 13095-47-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R)-2-hydroxypentanedioic acid, (2R)-2-hydroxypentanedioic acid, (2R)-hydroxyglutaric acid, (R)-(-)-2-hydroxyglutaric acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:32796 · EMBL-EBI · CC BY 4.0