Клиническая биохимия
N-carbamoyl-L-aspartate(2-)
N-carbamoyl-L-aspartate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «N-carbamoyl-L-alpha-amino acid anion». Для неё указаны формула C5H6N2O5 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H6N2O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 6, N — 2, O — 5. Средняя масса составляет 174.112 Да, а моноизотопная масса — 174.02877 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание N-carbamoyl-L-aspartate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H6N2O5 это приблизительно 1,74112 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: N-carbamoyl-L-aspartate(2-) — сопряжённое основание для «N-carbamoyl-L-aspartic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- N-carbamoyl-L-aspartate(2-)
- Класс ChEBI
- N-carbamoyl-L-alpha-amino acid anion
- Формула
- C5H6N2O5
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 174.112
- Моноизотопная масса, Да
- 174.02877
- InChIKey
- HLKXYZVTANABHZ-REOHCLBHSA-L
- Другие обозначения в ChEBI
- L-ureidosuccinate, N-carbamoyl-L-aspartate, N-carbamoyl-L-aspartate, N-carbamoyl-L-aspartate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:32814 · EMBL-EBI · CC BY 4.0