Клиническая биохимия
trans-2-decenoic acid
trans-2-decenoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «2-decenoic acid». Для неё указаны формула C10H18O2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H18O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 18, O — 2. Средняя масса составляет 170.252 Да, а моноизотопная масса — 170.13068 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание trans-2-decenoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H18O2 это приблизительно 1,70252 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: trans-2-decenoic acid — сопряжённая кислота для «(2E)-decenoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- trans-2-decenoic acid
- Класс ChEBI
- 2-decenoic acid
- Формула
- C10H18O2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 170.252
- Моноизотопная масса, Да
- 170.13068
- InChIKey
- WXBXVVIUZANZAU-CMDGGOBGSA-N
- CAS RN
- 334-49-6
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-dec-2-enoic acid, (2E)-dec-2-enoic acid, (2E)-decenoic acid, (E)-2-decenoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:50467 · EMBL-EBI · CC BY 4.0