Клиническая биохимия
(5-hydroxyindol-3-yl)acetaldehyde
(5-hydroxyindol-3-yl)acetaldehyde — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indoleacetaldehyde». Для неё указаны формула C10H9NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H9NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 9, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 175.187 Да, а моноизотопная масса — 175.06333 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (5-hydroxyindol-3-yl)acetaldehyde равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H9NO2 это приблизительно 1,75187 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C10H9NO2 — indole-3-acetic acid. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- (5-hydroxyindol-3-yl)acetaldehyde
- Класс ChEBI
- indoleacetaldehyde
- Формула
- C10H9NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 175.187
- Моноизотопная масса, Да
- 175.06333
- InChIKey
- OBFAPCIUSYHFIE-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 1892-21-3
- Другие обозначения в ChEBI
- (5-hydroxy-1H-indol-3-yl)acetaldehyde, (5-hydroxy-1H-indol-3-yl)acetaldehyde, 5-Hial, 5-Hydroxyindole-3-acetaldehyde
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:50157 · EMBL-EBI · CC BY 4.0